En primær samarbejdspartner er Forskerskolen i Kultur, Litteratur og Kunstfag, Københavns Universitet. Dette samarbejde er formaliseret i Det Danske Forskerskolekonsortium i Kultur, Litteratur og Kunstfag, der dels arrangerer nationale kurser, dels er dansk parthaver i flere internationale netværk.

Derudover samarbejder Akademiet for Æstetikfaglig Forskeruddannelse - foruden det løbende samarbejde med de øvrige forskerskoler/studieprogrammer under Det Humanistiske Fakultet - med følgende:

• Arkitektskolen i Århus  
• Kunstakademiets Arkitektskole i København  
• Det Kongelige Danske Kunstakademi, Billedskolerne, København

Aarhus Universitet, Faculty of Arts, samarbejder med universiteterne i Bologna og Siena om et årligt engelsksproget ph.d.-seminar i litteraturvidenskab, Synapsis, afholdt på skift i Bologna og Siena.

Sammen med Fakultetet og Institut for Æstetiske Fag indgår Forskerskolen i det internationale netværk Hermes. Consortium for Literary and Cultural Studies.